Les prix de la Fondation Irv et Helga Cooper apporteront un soutien essentiel à trois initiatives enthousiasmantes en matière de science ouverte. Les lauréats de 2024 ont fait progresser le domaine des neurosciences en renforçant l’inclusivité et l’accès aux données de neuro-imagerie et de génétique.
Prix international, Programme mondial sur la génétique de la maladie de Parkinson (GP2)
Le Programme mondial sur la génétique de la maladie de Parkinson (GP2) vise à mettre en place une collaboration à l’échelle mondiale pour accélérer radicalement la détection des facteurs génétiques de la maladie et à partir de ces connaissances établir un réseau de recherche pour étudier, diagnostiquer et traiter la maladie de Parkinson partout dans le monde. Les chercheurs du GP2 réunissent une multitude de données génétiques provenant de plus de 150 000 participants. Ils procèdent au génotypage de plus de 10 000 individus pour déterminer la cause génétique dans les cas de Parkinson monogénique afin de constituer des ensembles de références essentielles. Ils utilisent aussi les procédés de séquençage à lecture de fragments longs, pour analyser la variabilité structurelle et répétitive relativement difficile à cerner par les méthodes classiques de séquençage du génome.
Depuis son lancement en 2019, le GP2 a rassemblé des chercheurs situés dans 59 localisations différentes qui étudient plus de 145 cohortes. Ils ont réalisé le génotypage de plus de 35 000 échantillons de patients et de participants sains, et communiqué les données de 25 000 individus au monde scientifique. En retour, le CP2 a reçu à ce jour, près de 1 000 demandes d’accès aux données génétiques de la part de spécialistes.
Prix stagiaire international, Mohamed Abdelhack, Krembil Centre for Neuroinformatics, Centre de toxicomanie et de santé mentale
Le prix a été décerné pour l'engagement de longue date de Mohammed Abdelhack à partager et diffuser des connaissances de pointe en neurosciences computationnelles auprès des communautés étudiantes du Sud global, grâce à son implication substantielle en tant que mentor à Neuromatch Academy et à l'école d'été Imbizo en neurosciences computationnelles, ainsi qu'en tant que fondateur de Arabs in Neuroscience. Il a également démontré une dévotion à la science ouverte tout au long de ses travaux de recherche, menant à la création de logiciels ouverts pour traiter les données massives de 30 000 participants provenant de la UK Biobank et du Human Connectome Project.
Prix stagiaire canadien, Michelle Wang, Le Neuro, 91ÉçÇř
Le prix a été décerné pour l'implication de Michele Wang dans la communauté de la science ouverte en neuroimagerie, et son rôle de premier plan dans le développement de Nipoppy, une infrastructure logicielle ouverte pour le traitement de mégadonnées en neuroimagerie.
Le cadre Nipoppy précise les modalités d’organisation et de traitement des ensembles de données cliniques en neuro-imagerie à l’intention des chercheurs. Il s’appuie sur les explorations existantes en vue de faciliter l’adoption de bonnes pratiques afin de fournir des logiciels conviviaux et modulables. Dans l’écosystème actuel des logiciels de neuro-imagerie, Nipoppy favorise particulièrement la souplesse et la décentralisation dans l’analyse des données, et constitue ainsi un outil unique et précieux. Nipoppy a permis d’examiner les données de la Parkinson’s Progression Markers Initiative et du Réseau québécois de la maladie de Parkinson en utilisant des circuits existants en source ouverte et en documentant tous les paramètres à des fins de reproductibilité. Les informations brutes et les données d’imagerie par résonance magnétique traitées sont présentement conservées sur un serveur central et mises à la disposition des autres groupes de recherche du Neuro.
